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Teilprojekt A

Description: Das Projekt "Teilprojekt A" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung durchgeführt. Ziel des Projektes ist die Erstellung / Vervollständigung einer physischen Karte des Gerstegenoms und deren Verankerung an die genetische Karte. Zur Unterstützung eines laufenden internationalen Kooperationsprojektes (Pakt für Forschung, IPK/ACPFG Adelaide/TU München) wird mittels der anerkannten Technik des High information Content Fingerprinting (HICF) eine BAC Bibliothek (ca. 5-fache Repräsentation des haploiden Gerstegenoms) analysiert und in die im Aufbau befindliche physische Karte des Gerstegenoms integriert. Um eine effizient Nutzung der entstehenden Ressource zu erzielen, bedarf es der genetischen Verankerung der Contig Karte. Diese wird durch gen-basierte Screenings gepoolter BAC Bibliotheken und durch die Hochdurchsatz 454 Sequenzierung von 3000 BAC Klonen (plus 2000 in einer zweiten Förder-Phase) erzielt. Diese entstehende öffentliche Resource wird zukünftig die effiziente Isolierung eines (prinzipiell) jeden Gens aus Gerste, und zu großem Teil aus verwandten Arten wie Weizen und Roggen, erlauben. Sie wird außerdem als Grundlage für eine weitgehende Sequenzierung des Gerstegenoms dienen.

Types:

SupportProgram

Origin: /Bund/UBA/UFORDAT

Tags: München ? Gerste ? Roggen ? Weizen ? Genom ? Pflanzengenetik ? Genetik ? Klonen ? Kartographie ? Karte ? Forschungskooperation ? Ressource ? Ressourcennutzung ? Genetischer Fingerabdruck ? Isolierung ? Rechengut ? Screening [Voruntersuchung] ? Sequenzierung ?

Region: Saxony-Anhalt

Bounding box: 11.7333° .. 11.7333° x 52° .. 52°

License: cc-by-nc-nd/4.0

Language: Deutsch

Organisations

Time ranges: 2007-07-01 - 2011-06-30

Resources

Status

Quality score

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