Schwerpunktprogramm (SPP) 2125: Dekonstruktion und Rekonstruktion der pflanzlichen Mikrobiota, Teilprojekt: Genetische Faktoren bei Bakterien die eine Pilz assoziierte Dysbiose in Arabidopsis verhindern

Description: In diesem Projekt wollen wir den Beitrag einzelner Bakterienstämme zu der, durch diese vermittelten Schutzaktivität untersuchen und bakteriell bedingte Mechanismen identifizieren, welche die Belastung mit Pilzen und/oder deren Diversität beeinflussen. Das Hauptziel ist es, Mechanismen zu charakterisieren (spezifisch und/oder konserviert unter den Bakterien ) welche einzeln oder synergistisch eine Pilz assozierte Dysbiose in den Wurzeln von Arabidopsis verhindern können. Weiterhin ist die Identifikation von durch Bakterien vermittelten Mechanismen, welche das Immunsystem der Pflanze dabei unterstützen die Masse und Diversität der Pilze zu verändern, wichtig für die Entwicklung neuer Strategien um Pilzerkrankungen in Pflanzen kontrollieren zu können. Dabei ist es entscheidend redundante Funktionen unter SynCom Mitgliedern zu reduzieren indem eine vereinfachte aber dabei repräsentative Auswahl an Mitgliedern getroffen wird. So wird es möglich genau zu ermitteln in welchen Ausmaß Wechselwirkungen zwischen Bakterien und Pilzen in einer Gemeinschaft die Gesundheit der Wirtspflanze beeinflussen. Durch vielfältige Ansätze welche den Nachbau und Manipulation des Mikrobioms, Mikrobiomprofiling, hoch-auflösende Metatranskriptome auf Genomebene und high-throughput Screenings sowie funktionelle Studien beinhaltet, möchten wir durch Bakterien vermittelte Schlüsselfunktionen identifizieren welche durch die Anwesenheit von Pilzen ausgelöst werden, das Wachstum dieser beeinflussen und dadurch zu einem Gleichgewicht zwischen Pilzen und Wirt führen.

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Tags: Mikroökologie ? Wirtspflanze ? Bakterien ? Screening ? Mykose ? Immunsystem ? Studie ? Pilz ? Pflanze ? Angewandte Mikrobiologie ? Applied Microbiology ? Chemical Ecology ? Microbiomes of Plant Systems ? Mikrobiome pflanzlicher Systeme ? Organismic Interactions ? Organismische Interaktionen ? chemische Ökologie ?

Region: Nordrhein-Westfalen Nordrhein-Westfalen

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License: Creative Commons Namensnennung-keine Bearbeitung-Nichtkommerziell 4.0

Language: Deutsch

Organisations

• Max-Planck-Institut für Pflanzenzüchtungsforschung (Projektverantwortung)
• Umweltbundesamt (Bereitstellung)

Last harvest: 01.10.2026 00:10

Time ranges: 2018-01-01 - 2026-10-20

Alternatives

• Language: Englisch/English
  Title: Sub project: Bacterial genetic determinants preventing fungal dysbiosis in Arabidopsis roots
  Description: In this project, we aim at tracking the contribution of individual bacterial strains to the protective activity phenotype and at identifying bacteria-encoded mechanisms that modulate fungal load and/or community composition at the root interface. The major objective is to characterize multiple (strain-specific and/or conserved) competitive mechanisms that act independently or synergistically to prevent fungal dysbiosis in A. thaliana roots. Furthermore, the identification of bacteria-encoded mechanisms that supplement the host immune system to modulate fungal abundance and diversity in plant roots is also key for developing novel biocontrol strategies to prevent fungal diseases in plants. Reducing functional redundancies between SynCom members through the use of a simplified, yet representative multi-kingdom microbial consortium is key to mechanistically assess the extent to which competition between bacterial root commensals and fungi affect plant health in a community context. By using a multifaceted approach that includes microbiota reconstitution and manipulation experiments, microbial profiling methods, high-resolution genome-resolved metatranscriptomics, as well as high-throughput screens and functional studies, we aim at identifying key bacterial functions induced upon fungal competition sensing that modulate fungal growth and diversity at the root interface, thereby maintaining fungal-host homeostasis in roots.
  URL: https://ufordat.uba.de/UFORDAT/pages/PublicRedirect.aspx?TYP=PR&DSNR=1140531

Resources

• Webseite zum Förderprojekt

  https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/402123107 (Webseite) ✓

Status

Aktiv

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