Teilprojekt B

Description: Das Projekt "Teilprojekt B" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Universitätsklinikum Essen (AöR), Institut für Medizinische Strahlenbiologie durchgeführt. Ziel des vorliegenden Projektes ist es den Einfluss der Chromatinstruktur auf die Funktion des B-NHEJ zu untersuchen und zu testen inwiefern die starke Einschränkung dieses Reparaturweges, die in G0 Zellen beobachtet wird, auf die Kondensierung des Chromatins zurückzuführen ist. Folgende Aspekte werden untersucht: Die Kondensierung des Chromatins in G0 Zellen durch DAPI Färbung in Kombination mit quant. Bildanalyse. Der Einfluss von Änderungen der Chromatinstruktur durch hypotonische Behandlung auf den B-NHEJ in G0-Zellen. Die Zusammenhänge zwischen Änderung der DNA Methylierung und Chromatin Kondensierung. Dafür wird die Behandlung mit 5-Aza-C durch DAPI Färbung und Messung der B-NHEJ Aktivität optimiert. Unter optimierten Bedingungen wird die DNA Methylierung mittels Elisa bestimmt, durch Sequenzierung von Bisulfit modifizierter DNA in Gruppen von 3-6 CpGs verifiziert und der Methylierungsstatus der DNA in Promotorbereichen quant. durch Methylierungsprofil-Chips erfasst. Der Methylierungsstatus von G0 und G1 Zellen wird untereinander und mit Parametern, die die B-NHEJ Aktivität beeinflussen verglichen. Der Einfluss von miRNAs der DNMT1 auf die Aktivität von B-NHEJ wird erfasst. Die Auswirkungen von Proteinen der HP1 Familie wird durch Überexpression und Suppression mittels RNA-Interferenz auf die B-NHEJ Aktivität bestimmt. Da Zellen mit Defekten in DNA-PKcs keine Hemmung von B-NHEJ in G0 zeigen, sollen die Wechselwirkungen von DNA-PK auf die Chromatinstruktur analysiert werden.

Types:

SupportProgram

Origin: /Bund/UBA/UFORDAT

Tags: Bisulfit ? Fluoreszenz ? Physiologische Wirkung ? Strahlenbiologie ? Zellphysiologie ? Biologische Wirkung ? DNA ? Farbstoff ? Strahlenschaden ? Strahlenwirkung ? Bildverarbeitung ? Methylierung ? Kondensation ? Protein ? Quantitative Analyse ? Wirkungsanalyse ? Zelle ? Nukleare Sicherheit ? Kenngröße ? B-NHEJ ? Biochemische Reaktion ? Chromatin ? Chromosomen ? DNA-Reparatur ? Genexpression ? Hypotonische Lösung ? RNA ? Sequenzierung ? Teilchenbestrahlung ? Wechselwirkung ?

Region: Nordrhein-Westfalen

Bounding box: 6.76339° .. 6.76339° x 51.21895° .. 51.21895°

License: cc-by-nc-nd/4.0

Language: Deutsch

Organisations

• Bundesministerium für Bildung und Forschung (Bereitsteller*in)
• GSI Helmholtzzentrum für Schwerionenforschung GmbH (Mitwirkende)
• Technische Universität Darmstadt, Radiation Biology and DNA Repair, AG Löbrich (Mitwirkende)
• Umweltbundesamt (Bereitsteller*in)
• Universitätsklinikum Essen (AöR), Institut für Medizinische Strahlenbiologie (Betreiber*in)

Time ranges: 2014-09-01 - 2018-08-31

Resources

• Webseite zum Förderprojekt

  https://www.tib.eu/de/filter/?repno=02NUK037B (Webseite)

Status

Aktiv

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