Description: Das Projekt "Alternativmethoden: In silico Methoden zur Vorhersage von Substanzwirkungen anhand morphologischer und molekularer Fingerabdrücke (MORPHEUS)" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Charité, Universitätsmedizin Berlin, Campus Benjamin Franklin, Institut für Physiologie durchgeführt. Im MORPHEUS Projekt soll eine tierversuchsfreie Teststrategie aus in silico und in vitro Methoden entwickelt werden, die die effiziente Identifizierung und Charakterisierung von Substanzen mit schädigender Wirkung auf Mensch und Umwelt ermöglicht. Dazu sollen Cell Painting-Hochdurchsatz-Bildgebung und neuartige Techniken des maschinellen Lernens, genauer Deep Learning, etabliert und kombiniert werden, um anhand von Veränderungen sub-/zellulärer Strukturen charakteristische 'morphologische Fingerabdrücke' abzuleiten, die spezifische Wirkungen von Substanzen oder -gruppen auf Zellen verlässlich abbilden. Fokus der AG Volkamer (hier VP3) ist dabei die Entwicklung von in silico Methoden, genauer DL Modelle, basierend auf morphologischen sowie molekularer Inputdaten zur Vorhersage von Substanzwirkungen und zur Identifizierung charakteristischer Fingerabdrücke. Diese Modelle werden iterativ trainiert und validiert basierend auf frei verfügbaren Daten (Bray et al. 2017), sowie angewendet und optimiert auf sukzessiv durch VP1 und VP3 neu generierten Profilen ('Bioactive Library', 'BfR Library'). Abschließend sollen die neu generierten in silico Modelle angewendet werden, um umfangreiche Substanzbibliotheken effektiv nach Substanzen mit spezifischer Wirkungsweise zu durchsuchen, welche von VP1 und VP2 zudem experimentell überprüft werden.
SupportProgram
Origin: /Bund/UBA/UFORDAT
Tags: Berlin ? Umweltauswirkung ? Prognose ? Zellstruktur ? Schädliche Umwelteinwirkung ? Open Data ? Künstliche Intelligenz ? Zelle ? Änderung ? Nachweismethode ?
Region: Berlin
Bounding boxes: 13.41377° .. 13.41377° x 52.5233° .. 52.5233°
License: cc-by-nc-nd/4.0
Language: Deutsch
Time ranges: 2022-04-01 - 2025-03-31
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