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Subproject 2

Description: Das Projekt "Subproject 2" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Metabolomic Discoveries GmbH durchgeführt. Das Projekt DYNAMICS untersucht die Dynamik von industriellen Bioprozessen. Ziel ist es den Stoffwechsel und die Dynamik der Stoffwechselanpassungen besser zu verstehen, um industrielle Bioprozesse effizienter zu gestalten. Metabolomics, die Analyse aller Metabolite in einer biologischen Probe, ermöglicht umfassende Einblicke in die Physiologie und metabolischen Netzwerke unter den verschiedensten Bedingungen. Dabei werden bekannte und unbekannte Substanzen analysiert, charakterisiert und zusätzlich können diese auch quantifiziert werden. Hinter diesen Untersuchungen stecken hoch sensible, analytische Instrumente, wie Massenspektrometer (MS), die an Flüssig (LC)- oder Gaschromatographen (GC) gekoppelt sind. In diesem Vorhaben werden hochauflösende LC-MS und GC-MS parallel verwendet um das Metabolom nahezu vollständig abzudecken. Die Plattform erlaubt die Analyse von Molekülen mit molarer Masse von 50-1700 Da. Damit wird ein Molekülbereich von hochpolaren Verbindungen wie Aminosäuren oder Energieäquivalenten bis hin zu lipophilen Stoffen wie Phospholipide oder Fettsäuren abgedeckt. Bisher können ca. 30% der Metabolite annotiert werden. 70% der Metabolitpeaks sind unbekannte Substanzen. In dem Forschungsvorhaben sollen metabolische Flüsse und deren Dynamiken untersucht werden. Hierzu werden die von den Projektpartner 1, 2 und 4 generierten Proben auf ihre metabolische Zusammensetzung mit der umfassenden Metabolomicsplattform analysiert. Dies erlaubt die Detektion von ca. tausend Komponenten in Mikroorganismen. Die proprietäre, mehrere tausend Komponenten umfassende Metabolitdatenbank mit starken Fokus auf mikrobielle Metabolite, erlaubt die Identifikation derselbigen in den Proben. Unbekannte Metabolite können an Hand der akkuraten Masse (1-2ppm Massengenauigkeit) und Retentionszeit klassifiziert werden, hierbei helfen auch die Untersuchungen und Arbeiten der stabilen Isotopenmarkierung aus dem WP4 (Projektpartner 3).

Types:

SupportProgram

Origin: /Bund/UBA/UFORDAT

Tags: Aminosäure ? Fettsäure ? Messgerät ? Fluss ? Physiologie ? GC-MS ? Chemische Analyse ? Gaschromatografie ? Isotopentechnik ? Lipophiler Stoff ? Massenspektrometrie ? Messtechnik ? Stoffwechselprodukt ? Biotechnologie ? Messdaten ? Mikroorganismen ? Biologische Probe ? Prozesskettenanalyse ? Messung ? Forschungsprojekt ? Datenbank ? Datenerhebung ? Stoffwechsel ? Probenahme ? Effizienzsteigerung ? Analytik ? Dynamische Analyse ? Phospholipide ?

Region: Brandenburg

Bounding box: 13.01582° .. 13.01582° x 52.45905° .. 52.45905°

License: cc-by-nc-nd/4.0

Language: Deutsch

Organisations

Time ranges: 2015-03-01 - 2018-02-28

Status

Quality score

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