Description: Das Projekt "Teilprojekt 3" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart, Abteilung Entomologie durchgeführt. HIGH-LIFE soll es Nutzern an Synchrotron-Quellen mit niedriger Emittanz erstmalig ermöglichen, die 3D-Morphologie großer Serien kleiner Tiere hierarchisch digital abzubilden, auszuwerten und mit komplementären genetischen und ökologischen Daten zu korrelieren. Hierzu werden instrumentelle und methodische Lösungen für gemeinsame Anforderungen aus zwei Bereichen der aktuellen Forschung in den Lebenswissenschaften erarbeitet: (1) kleine Wirbeltiere, die wichtige Modellorganismen für die Entwicklungsbiologie und medizinische Forschung darstellen; (2) Insekten, die Schlüsselfunktionen in Ökosystemen erfüllen und als Bestäuber sowie in der biologischen Schädlingsbekämpfung große gesellschaftliche Relevanz besitzen. Jedoch erfordert eine umfassende Untersuchung beider Organismengruppen eine bisher nicht verfügbare qualitative und quantitative hierarchische 3D-Bildgebung mit hohem Probendurchsatz und adaptivem Gesichtsfeld. Ziel von HIGH-LIFE ist es, experimentelle Techniken nebst Datenerfassungs- und -verarbeitungs-Pipelines für die Digitalisierung der Morphologie kleiner Tiere mittels Synchrotronstrahlung zu etablieren. Durch die im Projekt entwickelten Protokolle werden dosis- und zeitoptimierte Hochdurchsatz- und in vivo-Messungen, sowie die Visualisierung und durch künstliche Intelligenz unterstützte korrelative Analysen der 3D-Datensätze ermöglicht. Hierzu wird insbesondere ein adaptiv einstellbares Gesichtsfeld realisiert, welches sowohl die Bildgebung ganzer Tiere, als auch ausgewählter morphologischer Details mit höherer Auflösung erlaubt. Ebenso werden Bildgebungsmodalitäten in Bezug auf Kontrast, Signal-zu-Rauschen-Verhältnis und Dosiseffizienz optimiert und die Kompatibilität zu (semi-)automatischer Segmentierung durch dedizierte Datenanalyse-Pipelines gewährleistet. Die hierzu erforderliche Instrumentierung sowie die entwickelte Pipeline werden final als zweiter Messplatz an P23 an PETRA III installiert und perspektivisch den Nutzern zur Verfügung gestellt.
Types:
SupportProgram
Origin: /Bund/UBA/UFORDAT
Tags: Stuttgart ? Insekt ? Entomologie ? Genökologie ? Morphologie ? Wirbeltier ? Entwicklungsbiologie ? Biologie ? Digitalisierung ? Domestiziertes Tier ? Umweltdaten ? Dosis ? Künstliche Intelligenz ? Testorganismus ? Biologische Schädlingsbekämpfung ? Tier ? Rohrfernleitung ? Ökosystem ? Rohrleitung ? Kompatibilität ? Auflösungsvermögen ? Visualisierung [Umweltinformation] ?
Region: Baden-Württemberg
Bounding box: 9° .. 9° x 48.5° .. 48.5°
License: cc-by-nc-nd/4.0
Language: Deutsch
Time ranges: 2019-07-01 - 2022-06-30
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