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Teilprojekt 1: Mikrobielle Biodiversität

Description: Das Projekt "Teilprojekt 1: Mikrobielle Biodiversität" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie e.V., Hans-Knöll-Institut, Abteilung Zell- und Molekularbiologie durchgeführt. Das Vorhabensziel betrifft die Aufklärung der mikrobiellen Diversität in Fisch und Meeresfrüchten (Muscheln, Krebstiere) unter verschmutzten Bedingungen in der Jakarta Bay. Die mikrobielle Diversität umfasst Bakterien, Pilze, Protisten und andere Mikroorganismen in einer für die Fischerei wichtigen, nicht-migrierenden Fischart, einer Krustentier Spezies und einer relevanten Muschelart und entsprechenden Kontrollen (z. Bsp.: Wasserproben in verschmutzten und sauberen Meeresregionen). Ein gegenwärtig wichtiger Aspekt ist dabei zu zeigen, ob innerhalb des Core-Microbioms/Metagenoms pathogene Mikroben gefunden werden, und wo diese Mikroben taxonomisch zugeordnet werden können (OTUs). Ein weiteres Projektziel betrifft die Ausbildung, Erfahrungsaustauch (wissenschaftlich, technisch und wirtschaftlich) und Verbreitung relevanter Resultate durch Publikationen, Datenbanken, Vorträge, etc. Die Arbeitsplanung solch komplexer Zielstellungen beinhaltet mehrere relevante Komponenten. Das erste Einsammeln von geeigneten Proben ist bereits zu Beginn des Projekts geplant (deutsche und indonesischen Partner). Die Tiere sollen aus verschiedenen Regionen der Jakarta Bay gesammelt werden. Nach Eintreffen der Proben, werden Nukleinsäuren isoliert, amplifiziert und mittels modernsten Sequenziertechnologien sequenziert und analysiert. Die in silico Analysen der Sequenzdaten in Hinsicht Mikrobiom, Metagenom, Pathogenanalysen sind sehr aufwendig und werden bis Ende der Projektzeit andauern.

Types:

SupportProgram

Origin: /Bund/UBA/UFORDAT

Tags: Fischart ? Krustazeen ? Fisch ? Genom ? Muschel ? Meeresverschmutzung ? Molekularbiologie ? Indonesien ? Einheimische Tierart ? Mikrobielle Vielfalt ? Bucht ? Küstengewässer ? Nukleinsäure ? Bakterien ? Internationale Zusammenarbeit ? Kausalzusammenhang ? Taxonomie ? Ausbildung ? Vergleichsanalyse ? Wasserprobe ? Wasseranalyse ? Mikroorganismen ? Pilz ? Meeresgewässer ? Meeresfrüchte ? Probenahme ? Fischerei ? Krankheitserreger ? Datenbank ? DNA-Amplifikation ? Bucht von Jakarta ? Sequenzierung ? Wassermikroorganismen ? Lebensgrundlage ? Mikrobiom ? Protisten ?

Region: Thuringia

Bounding box: 11° .. 11° x 50.91667° .. 50.91667°

License: cc-by-nc-nd/4.0

Language: Deutsch

Organisations

Time ranges: 2012-03-01 - 2016-12-31

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Status

Quality score

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