Detaillierte kinetische Modellierung, Identifikation und Analyse des Tricarbonsäurezyklus und der Atmungsketten in E. coli

Description: Das Projekt "Detaillierte kinetische Modellierung, Identifikation und Analyse des Tricarbonsäurezyklus und der Atmungsketten in E. coli" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Universität Stuttgart, Institut für Systemdynamik durchgeführt. In diesem Projekt wird die detaillierte Modellierung des Tricarbonsäurezyklus und der Atmungsketten in E. coli durchgeführt. Diese Stoffwechselmodule werden ein bereits existierendes und experimentell validiertes Modell der Kohlenhydrataufnahme und -metabolismus vervollständigen und insbesondere Sauerstoff-abhängige Regulationsprozesse umfassen. Das Modell wird dabei basierend auf Literaturdaten und experimentellen Daten der Projektpartner entwickelt und validiert. Es wird hierzu eine systemtheoretische Analyse der Identifizierbarkeit, sowie dann eine optimierungsbasierte Schätzung der sensitiven Reaktionsparameter durchgeführt. Das validierte Gesamtmodell erlaubt eine Analyse der Kohlenhydrat- und Elektronenflüsse bei verschiedener Sauerstoffversorgung. Es sollen relevante Schlüsselenzyme identifiziert, sowie die Regulationsstrategien von E. coli bezüglich Sauerstoff untersucht werden. Für die fermentative Kultivierung (z.B. bei industrieller Anwendung) spielt das Verständnis der Gesamtreaktion des Stoffwechsels auf verschiedene O2-Versorgung, wie vom Modell geleistet, eine wichtige Rolle. Die systemtheoretischen Werkzeuge können auch für weitere sysbiol. Projekte eingesetzt werden.

Types:

SupportProgram

Origin: /Bund/UBA/UFORDAT

Tags: Stuttgart ? Kolibakterien ? Carbonsäure ? Kohlenhydrat ? Sauerstoff ? Biologie ? Enzym ? Fermentation ? Organische Säure ? Atmung ? Literaturauswertung ? Chemische Verbindung ? Modellierung ? Landwirtschaft ? Stoffwechsel ? Elektronen ? Organische Sauerstoffverbindung ? Werkzeug ?

Region: Baden-Württemberg

Bounding box: 9° .. 9° x 48.5° .. 48.5°

License: cc-by-nc-nd/4.0

Language: Deutsch

Organisations

• Bundesministerium für Bildung und Forschung (Bereitsteller*in)
• Max-Planck-Gesellschaft (Mitwirkende)
• Umweltbundesamt (Bereitsteller*in)
• University Sheffield, Department of Electronic and Electrical Engineering (Mitwirkende)
• University Sheffield, Department of Molecular Biology and Biotechnology (Mitwirkende)
• Universität Stuttgart, Institut für Systemdynamik (Betreiber*in)
• Universität von Amsterdam, Swammerdam Institute für Lebenswissenschaften (SILS) (Mitwirkende)

Time ranges: 2007-05-01 - 2010-04-30

Resources

• Webseite zum Förderprojekt

  http://www.sysmo.net/ (Webseite)

• Webseite zum Förderprojekt

  https://www.tib.eu/de/filter?repno=0313984B (Webseite)

Status

Aktiv

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