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Teilprojekt C

Description: Das Projekt "Teilprojekt C" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Universität Bielefeld, Centrum für Biotechnologie durchgeführt. HotSysAPP möchte durch die Ausnutzung des stark vernachlässigten biotechnologischen Potentials der Archaeen einen Beitrag zur Bioökonomie leisten. Im Projekt sollen verbesserte Stämme mit innovativem Potential in konsolidierter Bioprozesstechnik mit Anwendungen in Fermentation und biokatalytischen Prozessen sowie neue 'Extremozym'-Systeme entwickelt werden. Für die Stammoptimierung wird ein Modell-basierter systembiologischer Ansatz unter Einsatz von aktuellen Hochdurchsatz-Technologien der Transkriptom-, Proteom-, und Metabolom-Analyse, sowie Modellierung, Genetik, Biochemie und Enzym-Engineering eingesetzt. In diesem Teilprojekt werden die Expressionsdaten auf Transkriptomebene erhoben, analysiert und interpretiert. Im Rahmen der Untersuchungen sind globale Analysen der Genexpression von besonderer Relevanz. In diesem Teilprojekt des Verbundvorhabens soll Hilfe der 'RNA-Sequenzierung' (RNAseq) die Genexpression quantifiziert und für die Genexpression wichtige Schaltelemente der Transkription (Promotoren, Terminatoren, antisense-Elemente) identifiziert werden. Die erfolgreiche Kombinierung dieser Elemente mit ausgewählten Genen wird dann ebenso in vivo mittels RNAseq getestet, um im Sinne einer Optimierung Modifikationen vorschlagen zu können. Dieser iterative Prozess betrifft zunächst die natürliche Expression aller Gene unter Produktionsbedingungen im Wildtyp und anschließend ähnliche Untersuchungen zu den gentechnisch veränderten Stämmen. Die Ergebnisse werden zusammen mit dem Partner P3 bioinformatisch analysiert und den Partnern P5 und P6 für die Modellierung übergeben.

Types:

SupportProgram

Origin: /Bund/UBA/UFORDAT

Tags: Bielefeld ? Gen ? Biochemie ? Genetik ? Synthetische Biologie ? Allergen ? Enzym ? Fermentation ? Katalyse ? Verfahrensparameter ? Industrielle Biotechnologie ? Bioverfahrenstechnik ? Bioökonomie ? Biotechnologie ? Gentechnisch veränderte Organismen ? Produktionstechnik ? Quantitative Analyse ? Vergleichsanalyse ? Modellierung ? Globale Aspekte ? Archaea ? Biochemische Reaktion ? Genexpression ? In-Vivo ? RNA ? Sequenzierung ? Transkription ?

Region: Nordrhein-Westfalen

Bounding box: 6.76339° .. 6.76339° x 51.21895° .. 51.21895°

License: cc-by-nc-nd/4.0

Language: Deutsch

Organisations

Time ranges: 2016-03-01 - 2019-02-28

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Status

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