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Teilprojekt 8: Koordination Projekt Pilze in Obstbau und Forstwirtschaft, Referenzbibliothek und Phylochip^GBOL: German Barcode of Life - Von der Wissenschaft zur Anwendung (GBOL-2)^Teilprojekt 11: Datenfluss und Analyse der Sequenzdaten, Bioinformatik Sanger & NGS Daten^Teilprojekt 9: Pathogene und nekrotische Pilze in Obstbau und Forstwirtschaft, Referenzbibliothek und Phylochip^Teilprojekt 10: DNA-Metabarcoding von Makrozoobenthos im Rahmen der EU Wasserrahmenrichtlinie (WRRL)^Teilprojekt 12: Design und Implementierung von pilzspezifischen Microarrays ('EcoChips') für die Diagnostik, Teilprojekt 7: Entwicklung von Standards (SOPs) für DNA-basierte Pollenidentifikation

Description: Der Verbund GBOL II wird weiter am Ausbau der ersten umfassenden 'DNA-Barcoding' - Gendatenbank der dt. Flora und Fauna arbeiten. Diese ermöglicht eine automatisierte Artbestimmung. Die Universität Gießen beabsichtigt hierzu Standardprotokolle für die DNA-basierte Pollenidentifikation zu entwickeln, die eine automatisierbare, standardisierbare, schnelle, qualitativ hochwertige Hochdurchsatzanalyse ermöglichen. Dazu bedarf es der standardisierten Probenahme (Luftpollen, zoophiler Pollen, Pollen aus Honig), automatisierbare Verfahren zur Lagerung, Reinigung, DNA-Isolierung, Amplifikation, Sequenzierung und Datenanalyse. Schwerpunkte liegen auf Arten, die (i) gesundheitliche Probleme verursachen (z.B. Allergien), (ii) die in pollenhaltigen Produkten vorkommen (z.B. Honig), sowie (iii) Pollen der wichtigsten landwirtschaftlichen insektenbestäubenden Arten. Die bereits existierende Referenzdatenbank wird erweitert und optimiert. Standardisierung der Probenahme - Vorhandene Techniken werden bezüglich ihrer Eignung zur DNA-basierten Identifikation getestet. Modifikationen werden nötig, z.B. zur optimierten Lagerung im Feld, sowie zur Reinigung von abiotischen und biotischen Verunreinigungen, um eine universell einsetzbare und übertragbare Methode zur Pollenprobennahme an multiplen Standorten mit qualitativ hochwertigen, reproduzierbaren Ergebnissen zu erhalten. Standardisierte Laborprotokolle - werden entwickelt, (i) zur optimierten automatisierbaren DNA-Isolation aus Pollen und (ii) zur Überprüfung der Qualität und Quantität der veröffentlichten DNA Barcoding Marker und deren Identifikationsgenauigkeit mittels NGS-Sequenzierung. Künstlich generierte Mischproben und Freilandproben werden analysiert. Die Ergebnisse münden in Empfehlungen für Standardisierungsbehörden. Erweiterung der GBOL-Referenzdatenbank um Voucher der wichtigsten pollenallergenen Pflanzen, der wichtigsten Honigpflanzen, sowie der wichtigsten landwirtschaftlich bedeutsamen insektenbestäubten Pflanzen.

Types: 
SupportProgram

Tags: Gießen ? Obstbau ? Befruchtung ? Tracer ? Deutschland ? Allergen ? Blütenpflanze ? Pflanzenart ? Probenaufbereitung ? DNA-Barcoding ? Luftprobe ? Feldstudie ? Agrarprodukt ? Schnelltest ? Statistische Analyse ? Technik ? Allergie ? Vergleichsanalyse ? Pilz ? Pflanze ? DNA-Analyse ? Analyseverfahren ? Automatisierung ? Datenbank ? Fauna ? Flora ? Forstwirtschaft ? Lagerung ? Pollen ? Standardisierung ? Probenahme ? Reinigungsverfahren ? Arbeit ? Referenzwert ? Genbank ? Isolierung ? Sequenzierung ? DNA-Amplifikation ? environmental Next Generation Sequencing (eNGS) ? Honig ?

Region: Hessen

Bounding boxes: 9° .. 9° x 50.55° .. 50.55°

License: Creative Commons Namensnennung-keine Bearbeitung-Nichtkommerziell 4.0

Language: Deutsch

Organisations

Time ranges: 2016-01-01 - 2018-12-31

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