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Population Genomics of Diapause Phenotypes in European Ips typographus Using High-Throughput RADseq

Description: Das Projekt "Population Genomics of Diapause Phenotypes in European Ips typographus Using High-Throughput RADseq" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Universität für Bodenkultur Wien, Institut für Forstentomologie, Forstpathologie und Forstschutz durchgeführt. Der exakte physiologische und somit reproduktive Zustand zum richtigen saisonalen Zeitpunkt ist ein entscheidender Faktor für das Überleben einer Insektenpopulation. Um dies zu bewerkstelligen haben Insekten eine genetisch vorprogrammierte Periode, welche Diapause genannt wird, entwickelt. Mit Hilfe der Diapause werden die einzelnen Stadien synchronisiert. Der genetische Hintergrund der Diapause soll beim europäischen Buchdrucker mittels Genomanalyse untersucht werden. Ein Anstieg der Temperatur hat schnellere Entwicklungsraten beim Buchdrucker und durch vermehrte Generationen pro Jahr größerere forstwirtschaftliche Schäden zur Folge. Die Genomanalyse Double Digest Restriction Site Associated DNA Sequencing ddRADSeq wird hier verwendet, um 1) die genetische Grundlage der nicht obligaten vs. der obligaten Diapause und 2) die europäischen I. typographus Populationen in Bezug auf Diapauseverhalten zu untersuchen. Öko-physiologisch definierte Individuen, welche unter exakten Temperaturbedingungen herangezogen werden, werden mittels ddRADSeq untersucht. Diese Analyse soll Information zur genetischen Basis des Diapauseverhaltens liefern. Da das Diapauseverhalten eine sehr komplexe Eigenschaft ist, kann nur eine Genomanalyse und somit die Analyse einer sehr hohen Anzahl an Loci Auskunft über dieses Verhalten geben. Die Loci, welche in Bezug auf das Diapauseverhalten einer Selektion unterliegen, werden in Folge bei der Analyse der europäischen Populationen herangezogen um lokale Unterschieden festzustellen. Diese Studie wird neben demographischen Ereignissen auch einen Einblick auf phänotypische Struktur zeigen - somit eine Abschätzung der obligat bzw. nicht obligat diapausierenden Käfer bringen.

Types:

SupportProgram

Origin: /Bund/UBA/UFORDAT

Tags: Käfer ? Populationsdynamik ? Insekt ? Tiererbgut ? Wien ? Entomologie ? Genökologie ? Ökophysiologie ? Tierphysiologie ? Tierverhalten ? Tiergenetik ? Borkenkäfer ? Sportanlage ? Temperaturabhängigkeit ? Forstschädling ? Waldschutz ? Geographie ? Jahreszeit ? Studie ? Demografie ? Wirkungsanalyse ? Dormanz ? DNA-Analyse ? Phylogenese ? Globale Veränderung ? Europa ? Population ? Biologische Entwicklung ? Diapauseverhalten ? New Generation Sequencing ? Phylogeographie ? Populationsanalyse ? Sequenzierung ? ddRAD-Seq ? Europäischer Buchdrucker ? Auslese ? Genlokalisation ? Genomanalyse ? Ips typographu ?

License: cc-by-nc-nd/4.0

Language: Deutsch

Organisations

Time ranges: 2014-07-01 - 2017-06-30

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