Das Projekt "Sub project Z02: Bioinformatics analysis of genomes and transcriptomes" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Helmholtz Zentrum München, Institut für Bioinformatik und Systembiologie (IBIS) durchgeführt. This is the bioinformatics service project of the SFB924. It will support and train all scientists involved in bioinformatic analysis.
Das Projekt "Schwerpunktprogramm SFB 924: Molekulare Mechanismen der Ertragsbildung und Ertragssicherung bei Pflanzen - Teilprojekt B11: Struktur und Funktion des CCaMK/CYCLOPS Komplexes" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Universität München, Biozentrum Martinsried, Lehrstuhl Genetik durchgeführt. Die Symbiosen der pflanzlichen Wurzel mit arbuskulären Mykorrhizapilzen und Stickstoff-fixierenden Bakterien bergen ein großen Potential für die nachhaltige Landwirtschaft. Jüngste Ergebnisse legen nahe, dass Kalzium und Calmodulin-abhängige Proteinkinasen (CCaMK), zusammen mit einem DNA-bindenden Transkriptionsaktivator, CYCLOPS, einen wichtigen regulatorischen Knotenpunkt bei der Entscheidung zwischen diesen beiden Symbiosen darstellen. Hier möchten wir die zugrundeliegenden molekularen Mechanismen für diesen Entscheidungsprozess untersuchen.
Das Projekt "Schwerpunktprogramm SFB 924: Molekulare Mechanismen der Ertragsbildung und Ertragssicherung bei Pflanzen - Teilprojekt A09: Funktionelle Charakterisierung der PATHOGENESIS RELATED10 (PR10) Gene" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Technische Universität München, Department für Lebensmittel und Ernährung, Professur für Biotechnologie der Naturstoffe durchgeführt. Wir beabsichtigen Liganden- und Protein-Interaktionspartner von Fra a zu finden, um zu prüfen, ob PR10 Proteine Metabolite binden und weitermelden können. Fra a defizitäre Genotypen und andere Linien werden benutzt um weitere Details zur Rolle der PR10 während der Infektion mit Pathogenen aufzuklären. Schließlich soll die alternative Hypothese geprüft werden, ob Fra a mit dem Tonoplast assoziiert ist und den Transport in die Vakuole vermitteln kann.
Das Projekt "Schwerpunktprogramm SFB 924: Molekulare Mechanismen der Ertragsbildung und Ertragssicherung bei Pflanzen - Teilprojekt B07: Funktionelle Analyse der Ralstonia solanacearum TAL Effektoren" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Universität Tübingen, Zentrum für Molekularbiologie der Pflanzen, Lehrstuhl Allgemeine Genetik durchgeführt. Ralstonia solanacearum ist ein wichtiges Pathogen bei Pflanzen. Zur Klärung des Codes von TALE-ähnlichen Proteinen (RATs) des bakteriellen Pathogens R. solana-cearum wollen wir RAT-Gene in planta exprimieren und Zielgene über Transkriptomanalysen identifizieren. Der RAT-Code soll anschließend zur Generierung von Promoterfallen verwendet werden, die Resistenz gegen R. solanacearum vermitteln. Weiterhin sollen in Arabidopsis-Ökotypen RAT-spezifische Resistenzgene identifiziert werden.
