Das Projekt "Novel software tools for improved processing and interpretation of metabolomics data" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Universität für Bodenkultur Wien, Interuniversitäres Department für Agrarbiotechnologie durchgeführt. In a typical metabolomics experiment huge amounts of raw data are generated. This makes the efficient automated data processing a necessity for state of the art metabolomics workflows. Especially in liquid chromatography-high resolution mass spectrometry (LC-HRMS) based metabolomics research, in which the data contain a large extent of noise and background related signals, data processing and visualisation still consist major bottlenecks. of analytical workflows. Within this project, novel algorithms and software tools for improved evaluation of metabolomics data will be developed: The developed tools will be applied to study cereals such as wheat and maize, filamanteous fungi and their biological interaction. The project has three specific goals: 1) Optimisation and integration of software tools for the processing of stable isotope assisted LC-HRMS based metabolomics into a single software suite 2) Development of generic R script(s) for data analysis, visualisation and statistics. These Scripts shall provide templates for various future metabolomics experiments 3) Application and refinement of the developed stable isotope labelling assisted workflows and software algorithms within a functional genomics study. In collaboration with the group of Gerhard Adam we want to identify and characterise polyketide-type secondary metabolites of F. graminearum putatively involved in Fusarium head blight pathogenesis.
Das Projekt "Metabolomics of exploding ants: Is voluntary self-sacrifice a mechanism to defend co-evolved microbiomes?" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Universität für Bodenkultur Wien, Interuniversitäres Department für Agrarbiotechnologie durchgeführt. Ameisenarten des Camponotus (Colobopsis) cylindricus-Komplexes (COCY) in den Regenwäldern. Borneos haben ein einzigartiges Verhalten entwickelt: Im Territorialkampf mit feindlichen Ameisen platzen sie auf und töten ihre Rivalen durch die klebrigen und stark reizenden Sekrete ihrer hypertrophen Mandibulardrüse. Selbstaufopferung kann auch bei anderen sozialen Insekten beobachtet werden, meist kollektiv bei der Nestverteidigung. Im Gegensatz dazu 'explodieren' COCY-Arbeiterinnen im Einzelkampf im Territorium. Vermutlich dient dieses Verhalten dazu, eine bestimmte Zusammensetzung von Mikroorganismen (Mikrobiom) auf den Blättern zu verteidigen, welche den Ameisen als Nahrung dient. Das Projekt will die Evolution der COCY-Ameisen und des Mikrobioms untersuchen und damit neue und wichtige Interaktionen zwischen diesen Regenwaldinsekten und ihren assoziierten Mikroorganismen und Pflanzen aufzeigen. Dies soll mit Methoden der Molekularbiologie, Genomforschung, Metabolomik und der Morphologie erfolgen.