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Hochaufloesende automatische Identifizierung von Mikroorganismen (Erstantrag)

Das Projekt "Hochaufloesende automatische Identifizierung von Mikroorganismen (Erstantrag)" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Gesellschaft für Biotechnologische Forschung mbH durchgeführt. Eine multidisziplinaere Arbeitsgruppe aus 10 verschiedenen Forschungslaboratorien entwickeln verschiedene Verfahren zur schnellen Identifizierung von Mikroorganismen am Bsp. der Gruppe der Pseudomonaden. Als analytisches Instrumentar werden Techniken aus der molekularen Genetik , Immunologie und analytischen Chemie eingesetzt, um Nukleinsaeuren, Proteine, Lipide, komplexe makromolekulare Profile und Antigene zu analysieren. Die Ergebnisse der einzelnen Methoden werden verglichen und hinsichtlich ihrer Moeglichkeiten der Bakterienidentifikation, -detektion und -quantifizierung evaluiert. Darueberhinaus dienen diese Methoden der schnellen strukturellen und funktionellen Charakterisierung verschiedener Bakteriengemeinschaften an natuerlichen oder kontaminierten Standorten 1.) Erstellung von 16S rRNA Gensequenz Datenbanken zur phylogenetischen Analyse von Pseudomonaden. 2.) Neueinteilung der Pseudomonaden aufgrund ihrer unterschiedlichen polaren Lipide 3.) Entwicklung von gattungsspezifischen und artspezifische Antikoerpern zur schnellen Identifizierung von Pseudomonaden. 4.) Identifizierung von Pseudomonaden aufgrund ihrer niedermolekularen RNA-Profile.

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