Zielsetzung: Bestimmung der Praevalenz von VRE in Gefluegel- und Schweinefleisch. Untersuchung auf A- und B-Gene mit Hilfe der Polymerase Kettenreaktion. Vergleich von A-positiven Isolate von Lebensmitteln und von Menschen mit Hilfe der Randonly Amplified DNA (RAPD) und Puhfeldgelelektrophorese (PFGE).
The Trans-Amazon Drilling Project (TADP) recovered long drill core sequences from the Brazilian Amazon to reconstruct the evolutionary history of the Amazon’s climate, fluvial system, and the composition and diversity of its forests. The original plan included a transect of three sites: the Acre Basin in the west, a central site in the Solimões Basin, and a third site in the Marajó Basin in the east. Plans for drilling in the Solimões Basin site were ultimately abandoned because of high inflation following the Covid-19 pandemic leading to budget constraints. This report summarizes the personnel, drilling engineering plans, operations, and ongoing analytical plans for the TADP drill cores that were recovered from the western and eastern Amazon in 2023 and 2024. All datasets provided in the operational dataset (Bezerra et al., 2026?) of the ICDP project Trans-Amazon Drilling Project (TADP) with the ICDP expedition identifier 5066 consist of metadata and data generated during the operational phases in 2023 and 2024. Here, a summary of explanations of the tables and data from the database of the project (mDIS TADP) are given and are complimented by additional information on data from measurements done in the field. Some basic definitions of identifiers used in ICDP are also introduced. All data and images from the laboratory work and first sampling party are available at the CSD database (https://osf.io/cp8wn/, available after login).
Die gezielte Nutzung von Resistenzgenen wird durch Markierung erheblich erleichtert. In diesem Projekt werden 33 molekulare Marker (RAPD, AFLP, Mikrosatelliten) auf dem Chromosom 2 BL auf Kopplung mit dem Resistenzgen Yr5 gegen Gelbrost des Weizens untersucht und ein Abstand von etwa 10 cM erreicht. Zu unbekannten neuen Resistenzgenen gegen Echten Mehltau aus Triticum dicoccon und T. durum wurden mehrere gekoppelte Mikrosatelliten gefunden.
Der maispathogene Pilz Gibberella fujikuroi verursacht Kolben- und Stengelfaeule und gibt karzinogene Toxine in die Wirtspflanze ab. Ziele des Forschungsvorhabens sind: 1. Die artspezifische Diagnose: fruehzeitige Detektion des Erregers im Wirtsgewebe und Unterscheidung von anderen maispathogenen Pilzen. 2. Die genetische Analyse: Erfassung inter- und intraspezifischer genetischer Diversitaet von (natuerlichen) Gibberella fujikuroi-Erregerpopulationen unterschiedlicher geographischer Herkuenfte. Es wurden bisher Feldisolate von G. fujikuroi aus Kenia, Italien und Deutschland analysiert. Die Befunde zeigen, dass der Erreger einen hohen Polymorphiegrad besitzt. In Clusteranalysen ergeben sich Gruppierungen entsprechend den verschiedenen Fusarium-Anamorphen des Pilzes: Fusarium subglutinans, Fusarium proliferatum, Fusarium verticillioides bzw. moniliforme. Von den mittels PCR amplifizierten RAPD-Fragmenten konnten einige identifiziert werden, die fuer eine Diagnose geeignet erscheinen. Ein artspezifisches Primerpaar fuer den Nachweis von F. prolieratum mittels PCR liegt bereits vor. Weitere spezifische Primerpaare fuer den Nachweis von F. subglutinans und F. verticillioides bzw. moniliforme sind in der Entwicklung.
General Information: The cyanobacteria are a phylogenetically coherent taxon of oxygenic phototrophic prokaryotes whose range of morphological diversity is greater than that of any other group of microorganisms. They represent a unique source of biodiversity for both fundamental and applied research but previous difficulties encountered in their culture, axenization and systematics have prevented thorough study of their potential. With the first two problems largely overcome, this project proposes a timely investigation of cyanobacterial systematics (employing phenotypic, genotypic, physiological and biochemical characters), a search for compounds of biotechnological interest, and a study of species diversity in the natural environment. The project will be based on the 600 axenic strains available in the Pasteur Culture Collection of Cyanobacteria (PCC) and is composed of three work packages. I. Biosystematics: comparative approaches for definition of taxa. A characterization of the phenotypic and physiological properties of cyanobacteria will involve: cellular morphology and differentiation; photosynthetic pigments; physiology (heterotrophic potential, N2 fixation, temperature maxima, salt tolerance); biochemical constituents (lipids, fatty acids, carotenoids, exopolysaccharides). These studies will be complemented and extended by high resolution molecular techniques applied to total genomic DNA (determination of molar G+C content and genetic complexity, DNA-DNA hybridization, DNA fingerprinting with RFLP and RAPD) or to individual genes (restriction pattern analysis following hybridization to specific probes). Protein fingerprinting will be performed by electrophoretic separation of total or soluble proteins. Phylogenetic analysis will employ the sequences of 16S rRNA and the intergenic transcribed spacer regions (ITS). II. Bioactive compounds and others of biotechnological interest. Some of the activities in work package I, although designed for biosystematic studies, will reveal compounds of potential interest (lipids, fatty acids, carotenoids and exopolysaccharides). Work package II is devoted more specifically to bioactive compounds and includes an examination of the synthesis and mode of action.
In diesem Projekt sollen molekulare Marker fuer Braunrostresistenzgene entwickelt werden. Solche Marker sollen sowohl fuer Gene, die im Keimlingsstadium aktiv sind (Lr1) wie auch fuer Resistenzgene, die im Adultstadium aktiv sind (Lr13), gesucht werden. Molekulare Marker fuer Lr-Gene werden die Kombination von verschiedenen Lr-Genen in der gleichen Pflanze ermoeglichen und die Zuechtung auf dauerhafte Resistenz verbessern.
Im Rahmen des geplanten Vorhabens wird die genetische Struktur und Diversitaet natuerlicher Erregerpopulationen der nahe verwandten Arten F. culmorum und F. graminearum mittels molekularer Marker (RAPDs) untersucht. Von natuerlich infizierten Aehren aus Weizen- bzw. Roggenbestaenden verschiedener geographischer Regionen werden Pilzpopulationen mit jeweils 100 Einspor-isolaten von F. culmorum und F. graminearum erstellt und anhand ihrer genetischen Fingerprints charakterisiert. Mit Multilocus-Haplotypen- bzw. Allelfrequenzen kann die Verteilung und das Ausmass der genetischen Variation zwischen und innerhalb der Arten und Populationen geschaetzt werden. Moeglicher Genfluss zwischen lokalen Populationen, sowie die Groesse des Gametenphasen-Ungleichgewichts koennen zudem als wichtige Kenngroessen der Populationsstrukturierung ermittelt und verglichen werden. Weiterhin wird in Infektionsexperimenten der Einfluss der parasitischen Fitness auf die Zusammensetzung binaerer Mischungen von F.-culmorum-Genotypen bekannter Aggressivitaet untersucht. Dazu werden Pilzgenotypen eingesetzt, die mit RAPD- und sequenzpezifischen PCR-Markern eindeutig unterscheidbar sind. Der Vergleich der Haeufigkeiten, mit denen unterschiedlich aggressive Isolate nach kuenstlicher Infektion wiedergefunden werden, ermoeglicht Aussagen ueber die Konkurrenzfaehigkeit von Fusarium-Genotypen in heterogenen Pilzpopulationen. Hierbei interessiert besonders die Wirkung von Umwelteinfluessen und der Resistenzeigenschaften des Wirtes auf die Populationsstruktur unter Gewaechshaus- und Feldbedingungen. Die Ergebnisse dienen als Grundlage zur Entwicklung effizienter Strategien in der Resistenzzuechtung.
Studium der Vererbung bestimmter Eigenschaften; Erforschung von Grundlagen fuer die Elternwahl in der Zuechtung; Verbreiterung der genetischen Basis bei der Schorfresistenz; Sorten- und Genidentifikation mit Hilfe molekulargenetischer Marker (RAPD-PCR).
Genetische Variabilitaet ist die Voraussetzung fuer die Anpassung von Waldbestaenden an heterogene Umweltsituationen. Die Ueberlebensfaehigkeit von Baumpopulationen und die Stabilitaet der durch sie getragenen forstlichen Oekosysteme werden entscheidend durch die vorhandene genetische Variation gepraegt. In Zusammenarbeit mit elf anderen europaeischen Arbeitsgruppen soll das grosse Potential molekulargenetischer Methoden genutzt werden, um genetische Variation in Waldbestaenden zu erfassen und zu quantifizieren. Nachweis der genetischen Kontrolle von DNA-Markern (random amplified polymorphic DNA, sequence-characterized amplified regions) durch Analyse ihrer Segregation in Vollgeschwisterfamilien, Erprobung molekulargenetischer Marker fuer die Identifikation der Genotypen von Waldbaeumen (Fichte, Tanne), Vergleich der entwickelten Methoden mit konventionellen Methoden (Isoenzyme). Molekulargenetische Marker werden fuer genetische Inventuren benoetigt und sind Bestandteil von Massnahmen zur Erhaltung der biologischen Diversitaet und zum Schutz genetischer Ressourcen.
| Organisation | Count |
|---|---|
| Bund | 8 |
| Europa | 1 |
| Land | 1 |
| Wissenschaft | 6 |
| Type | Count |
|---|---|
| Förderprogramm | 8 |
| Text | 1 |
| License | Count |
|---|---|
| Offen | 9 |
| Language | Count |
|---|---|
| Deutsch | 7 |
| Englisch | 2 |
| Resource type | Count |
|---|---|
| Keine | 9 |
| Topic | Count |
|---|---|
| Boden | 4 |
| Lebewesen und Lebensräume | 9 |
| Luft | 3 |
| Mensch und Umwelt | 9 |
| Wasser | 3 |
| Weitere | 9 |