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Teilprojekt 3: Erweiterung Referenzbibliothek, DNA Barcoding von Eiparasitoiden (Gattung Trichogramma) für die biologische Schädlingsbekämpfung (SOPs)^Teilprojekt 6: DNA Barcoding von Bestäubergemeinschaften zur Ertragssteigerung in der Landwirtschaft (SOPs)^Teilprojekt 8: Koordination Projekt Pilze in Obstbau und Forstwirtschaft, Referenzbibliothek und Phylochip^GBOL: German Barcode of Life - Von der Wissenschaft zur Anwendung (GBOL-2)^Teilprojekt 5: Erweiterung Referenzbibliothek (Samenpflanzen (Spermatophytina) und anwendungsrelevante Arten)^Teilprojekt 11: Datenfluss und Analyse der Sequenzdaten, Bioinformatik Sanger & NGS Daten^Teilprojekt 12: Design und Implementierung von pilzspezifischen Microarrays ('EcoChips') für die Diagnostik^Teilprojekt 4: Verifikation von Saatgut und Baumschulware, DNA Barcoding von Diatomeen im Rahmen der EU Wasserrahmenrichtlinie (WRRL), Erstellung von SOPs^Teilprojekt 7: Entwicklung von Standards (SOPs) für DNA-basierte Pollenidentifikation^Teilprojekt 10: DNA-Metabarcoding von Makrozoobenthos im Rahmen der EU Wasserrahmenrichtlinie (WRRL)^Teilprojekt 9: Pathogene und nekrotische Pilze in Obstbau und Forstwirtschaft, Referenzbibliothek und Phylochip, Teilprojekt 2: Erweiterung Referenzbibliothek, NGS Protokolle invasive Arten (SOPs terrestrische Fauna)

Das Verbundprojekt GBOL II wird weiterhin am Ausbau der ersten umfassenden DNA-Barcoding-Gendatenbank der deutschen Flora und Faun arbeiten, dabei aber zunehmend angewandte Aspekte berücksichtigen. Vorhabensziele der Zoologischen Staatssammlung München - ZSM (Staatliche Naturwissenschaftlichen Sammlungen Bayerns - SNSB) gliedern sich in: Task A1: DNA Barcoding von 6000 bisher nicht erfassten Tierarten Deutschlands, Katalogerstellung, Daten-Bereitsstellung in einer öffentlich zugänglichen Datenbank. Taxonomische Schwerpunkte: Lepidoptera, Coleoptera, Hymenoptera. Weitere Schwerpunkte: RL Arten, FFH Arten, alte Museumsbelege (v.a. Typenmaterial). Task C5.1: Entwicklung einer schnellen und preisgünstigen NGS-gestützten Monitoring-Strategie am Beispiel invasiver Arten im NP Bayerischer Wald. Task D2: DNA-Referenz-Katalog-Erstellung sowie Entwicklung einer schnellen und preisgünstigen Nachweismethodik für wichtige Organismen in Forensik, Lebensmittelkontrolle und Getränkeherstellung, Bereitstellung der Daten in einer öffentlich zugänglichen Datenbank. Arbeitsplan: Task A1: in den Jahren 1-3 sollen 5000/5000/6300 Proben bearbeitet werden, davon 6560 alte Museumsobjekte im NGS-gestützten 'Prosser-Verfahren'. Erreichen der Anwendungsreife an der ZSM im 3. Jahr. Task C5.1: In den Jahren 1 und 2 sollen Malaisefallen-Aufsammlungen an 9 Stellen im Unteren Donautal und im NP Bayerischer Wald erfolgen (216 Teilproben). Im ersten und zweiten Jahr werden die Arten von je 75 Massenproben per NGS (je 10 Mio. reads) identifiziert, im dritten Jahr von weiteren 150 Proben inkl. Tests von Alternativverfahren (weitere 20 Mio. reads). Parallel dazu werden 3165 selektierte Proben im voucher-based Sanger-Verfahren bearbeitete werden. Task D2: Im ersten Jahr sollen 600, im zweiten Jahr 900 und im dritten Jahr 1500 Proben aus Forensik, Lebensmittelkontrolle und Getränkeherstellung bearbeitet werden. Insgesamt sollen 100 Mischproben (Lebenmittelkontrolle) und Massenproben (Forensik) per NGS-Verfahren identifiziert werden.

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