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Teilprojekt 3: Effekte auf die mikrobielle Gemeinschaft der Rhizosphaere

Das Projekt "Teilprojekt 3: Effekte auf die mikrobielle Gemeinschaft der Rhizosphaere" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Biologische Bundesanstalt für Land- und Forstwirtschaft durchgeführt. Veraenderung der mikrobiellen Gemeinschaft der Kartoffelrhizosphaere durch den Anbau transgener T4-Lyzosym exprimierender Linien werden freisetzungsbegleitend untersucht. Rhizosphaerenproben, die entsprechend einer biometrischen Versuchsplanung zu drei verschiedenen Entwicklungsstadien waehrend der Vegetationsperiode gezogen wurden, werden vergleichend fuer viele hochexprimierende T4-Lyzosym-Karoffellinien, die transgene Kontrolle sowie die nicht veraenderte Ausgangssorte auf der 'community'-Ebene untersucht. Zur Analyse der strukturellen Diversitaet der mikrobiellen Gemeinschaft werden vorrangig kultivierungsunabhaengige Verfahren basierend auf der Analyse direkt extrahierter DNA eingesetzt. Aus Gesamt-DNA PCR-amplifizierte 16S oder 18S rDNA-Fragmente werden mit Hilfe der denaturierenden Gradientengelelektrophorose (DGGE) analysiert. Differenzierende Banden werden sequenziert oder zur Herstellung von V6-Sonden genutzt. Zusaetzlich wird ein Monitoring des Ueberlebens und horizontalen Gentransfers transgener Agrobacterium Rhizogenesstaemme durchgefuehrt.

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